...非编码测序产品H1助力客户发文53篇,累计影响因子342.1!
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时间:23小时前
长期关注基因研究的科研工作者,往往聚焦于编码蛋白质的基因,而忽视了非编码序列的潜力。非编码RNA在生命活动方面扮演着至关重要的角色,是当前生命科学研究的热点之一。通过非编码RNA测序技术,深入研究非编码基因序列,揭示它们在基因、表观遗传和疾病发生等的作用。诺禾致源致力于助力客户科学研究,提供高质量测序服务。仅2024年上半年,非编码测序产品已助力客户发文53篇,累计影响因子342.1!以下几篇项目文章,分享了最新的科研成果。
长链非编码RNA是大豆多种驯化性状和叶蝉抗性的基础。文章《Long noncoding RNAs underlie multiple domestication traits and leafhopper resistance in soybean》在《NATURE GENETICS》期刊发表,影响因子30.8,时间为2024年5月。研究发现,调节大豆不同驯化性状的多个数量性状位点是由两个串联的lncRNA基因组成的位点的多效应。这些lncRNA基因各含有两个反向重复序列,源自MYB基因的编码序列,在野生大豆中的功能是产生小RNA(sRNA)物种簇,通过转录后抑制其MYB基因亲属的表达。相比之下,lncRNA基因在栽培大豆中的表达受到严重抑制,因此相应的MYB基因高度表达,形成了多种明显的驯化性状以及叶蝉抗性。
受XBP1s调节的circUbqln1与14-3-3ζ相互作用,通过控制PRODH活性和脯氨酸代谢,抑制胶原蛋白合成并促进骨关节炎的发生。文章《The circUbqln1, regulated by XBP1s, interplays with 14-3-3ζ to inhibit collagen synthesis and promote osteoarthritis by controlling PRODH activity and proline metabolism》在《Journal of Advanced Research》期刊发表,影响因子10.7,时间为2024年1月。研究发现,与正常小鼠相比,软骨特异性XBP1 cKO小鼠表现出更快的OA进展。重要的是,转录因子XBP1s能够阻碍由Ubqln1衍生的circUbqln1的生物生成。机制上,circUbqln1可在磷酸化14-3-3f的协助下转位至软骨细胞核,上调脯氨酸脱氢酶(Prodh)启动子的转录活性和PRODH酶的活性,从而导致软骨细胞核中的脯氨酸脱氢酶(Prodh)酶活性降低。因此,这会促进脯氨酸的降解,抑制胶原蛋白的合成,最终导致软骨及其结构完整性受损。
整合分析揭示了口腔微生物群失调与口腔鳞状细胞癌患者遗传和表观遗传异常之间的关联。文章《Integrative analysis reveals associations between oral microbiota dysbiosis and host genetic and epigenetic aberrations in oral cavity squamous cell carcinoma》在《npj Biofilms and Microbiomes》期刊发表,影响因子9.2,时间为2024年1月。研究表明,人类口腔微生物群的菌群失调与口腔鳞状细胞癌(OSCC)有关,而关于致病菌对宿主基因组和表观基因组异常的潜在影响的研究仍然很少。研究同时分析了OSCC患者肿瘤及其邻近正常组织的粘膜细菌群落、宿主全基因组转录组和DNA CpG甲基化。在OSCC肿瘤微环境中观察到7种细菌(核酸镰刀菌、特雷波介质菌、口腔普氏链球菌、莫比尔鹅膏菌、莫比尔卡托奈尔菌、尤里普氏杆菌和西米亚普氏球菌)的相对丰度显著富集。这些肿瘤富集细菌与206个上调的宿主基因形成了254个正相关,主要涉及与细胞粘附、迁移和增殖相关的信号通路。
EP300-ZNF384可通过转录IL3RA促进B细胞急性淋巴细胞白血病的进展。文章《EP300-ZNF384 transactivates IL3RA to promote the progression of B-cell acute lymphoblastic leukemia》在《Cell Communication and Signaling》期刊发表,影响因子8.4,时间为2024年4月。研究表明,EP300-ZNF384能显著诱导IL3RA的转录和IL3Rα(CD123)在B-ALL细胞膜上的表达。补充白细胞介素3(IL-3)可通过激活STAT5促进EP300ZNF348阳性B-ALL细胞的增殖。条件性敲除EP300-ZF384阳性细胞中的IL3RA可抑制体外增殖,并显著提高小鼠的总存活率,这归因于白血病细胞的繁殖能力受损。
以上文章展示了非编码测序技术在生命科学研究中的重要作用,以及诺禾致源在推动科学研究方面的贡献。这些研究不仅揭示了非编码RNA在不同生物学过程中的作用,还为理解疾病机制提供了新视角,为临床治疗提供了潜在靶点。
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时间:23小时前
长期关注基因研究的科研工作者,往往聚焦于编码蛋白质的基因,而忽视了非编码序列的潜力。非编码RNA在生命活动方面扮演着至关重要的角色,是当前生命科学研究的热点之一。通过非编码RNA测序技术,深入研究非编码基因序列,揭示它们在基因、表观遗传和疾病发生等的作用。诺禾致源致力于助力客户科学研究,提供高质量测序服务。仅2024年上半年,非编码测序产品已助力客户发文53篇,累计影响因子342.1!以下几篇项目文章,分享了最新的科研成果。
长链非编码RNA是大豆多种驯化性状和叶蝉抗性的基础。文章《Long noncoding RNAs underlie multiple domestication traits and leafhopper resistance in soybean》在《NATURE GENETICS》期刊发表,影响因子30.8,时间为2024年5月。研究发现,调节大豆不同驯化性状的多个数量性状位点是由两个串联的lncRNA基因组成的位点的多效应。这些lncRNA基因各含有两个反向重复序列,源自MYB基因的编码序列,在野生大豆中的功能是产生小RNA(sRNA)物种簇,通过转录后抑制其MYB基因亲属的表达。相比之下,lncRNA基因在栽培大豆中的表达受到严重抑制,因此相应的MYB基因高度表达,形成了多种明显的驯化性状以及叶蝉抗性。
受XBP1s调节的circUbqln1与14-3-3ζ相互作用,通过控制PRODH活性和脯氨酸代谢,抑制胶原蛋白合成并促进骨关节炎的发生。文章《The circUbqln1, regulated by XBP1s, interplays with 14-3-3ζ to inhibit collagen synthesis and promote osteoarthritis by controlling PRODH activity and proline metabolism》在《Journal of Advanced Research》期刊发表,影响因子10.7,时间为2024年1月。研究发现,与正常小鼠相比,软骨特异性XBP1 cKO小鼠表现出更快的OA进展。重要的是,转录因子XBP1s能够阻碍由Ubqln1衍生的circUbqln1的生物生成。机制上,circUbqln1可在磷酸化14-3-3f的协助下转位至软骨细胞核,上调脯氨酸脱氢酶(Prodh)启动子的转录活性和PRODH酶的活性,从而导致软骨细胞核中的脯氨酸脱氢酶(Prodh)酶活性降低。因此,这会促进脯氨酸的降解,抑制胶原蛋白的合成,最终导致软骨及其结构完整性受损。
整合分析揭示了口腔微生物群失调与口腔鳞状细胞癌患者遗传和表观遗传异常之间的关联。文章《Integrative analysis reveals associations between oral microbiota dysbiosis and host genetic and epigenetic aberrations in oral cavity squamous cell carcinoma》在《npj Biofilms and Microbiomes》期刊发表,影响因子9.2,时间为2024年1月。研究表明,人类口腔微生物群的菌群失调与口腔鳞状细胞癌(OSCC)有关,而关于致病菌对宿主基因组和表观基因组异常的潜在影响的研究仍然很少。研究同时分析了OSCC患者肿瘤及其邻近正常组织的粘膜细菌群落、宿主全基因组转录组和DNA CpG甲基化。在OSCC肿瘤微环境中观察到7种细菌(核酸镰刀菌、特雷波介质菌、口腔普氏链球菌、莫比尔鹅膏菌、莫比尔卡托奈尔菌、尤里普氏杆菌和西米亚普氏球菌)的相对丰度显著富集。这些肿瘤富集细菌与206个上调的宿主基因形成了254个正相关,主要涉及与细胞粘附、迁移和增殖相关的信号通路。
EP300-ZNF384可通过转录IL3RA促进B细胞急性淋巴细胞白血病的进展。文章《EP300-ZNF384 transactivates IL3RA to promote the progression of B-cell acute lymphoblastic leukemia》在《Cell Communication and Signaling》期刊发表,影响因子8.4,时间为2024年4月。研究表明,EP300-ZNF384能显著诱导IL3RA的转录和IL3Rα(CD123)在B-ALL细胞膜上的表达。补充白细胞介素3(IL-3)可通过激活STAT5促进EP300ZNF348阳性B-ALL细胞的增殖。条件性敲除EP300-ZF384阳性细胞中的IL3RA可抑制体外增殖,并显著提高小鼠的总存活率,这归因于白血病细胞的繁殖能力受损。
以上文章展示了非编码测序技术在生命科学研究中的重要作用,以及诺禾致源在推动科学研究方面的贡献。这些研究不仅揭示了非编码RNA在不同生物学过程中的作用,还为理解疾病机制提供了新视角,为临床治疗提供了潜在靶点。